أنشئ المعهد عام 1904 تحت اسم « معمل الباثولوجي « وذلك في معمل مستقل
داخل مبني كلية الطب البيطري بجامعة القاهرة ثم صار تحديثه تحت اسم الإدارة العامة للمعامل والبحوث البيطرية وذلك بالمبني الحالي له بشارع نادي الصيد بالدقي . وفي عام 1983 صدر القرار الجمهوري بإنشاء مركز البحوث الزراعية ويضم معهد بحوث الصحة الحيوانية .تم اعادة تقييم وظائف مركز البحوث الزراعية وتحديد اختصاصات أجهزة مركز البحوث الزراعية المعاهد التابعة له بقرار وزير الزراعة واستصلاح الأراضى رقم 144 لسنة 1978 .وتم تقسيم معهد بحوث الصحة الحيوانية الى ثلاث معاهد مستقلة وهى :
•المعهد الرئيسى بالدقى والمعامل الفرعية التابعة له فى جميع محافظات مصر.
•معهد بحوث الأمصال واللقاحات البيطرية بالعباسية
•معهد بحوث التناسليات الحيوانية بالهرم
تعرف على المعهد